明伦堂是儒学署的主要建筑，原是古时文人进行学术研讨的场所。位于仪门北，始建于明天启四年（1624），清雍正五年、乾隆七年与十七年又先后修葺，原共有五楹，深三丈余。现面阔20.6米，进深12.7米，高10.37米，建筑面积为261.6平方米，是崇明县博物馆的临时展厅。