崇圣祠又名“崇圣宫”，位于大成殿北、尊经阁东，始建于清雍正五年（1727），共三楹，昔前有大门，后为正殿，是奉祀孔子父母的场所。乾隆七年、十四年、二十七年、同治八年又先后修葺。今为单檐歇山式砖木斗栱建筑，面阔12.5米，进深11.75米，高11米，占地面积169.62平方米。崇圣祠内现布展“崇明民俗”陈列。